水稻多组学数据库(eRice)

水稻多组学数据库(eRice)于2020年创建,围绕水稻育种重大需求,将人工智能技术应用于表观组学大数据分析和预测,形成人工智能生物技术的基础理论和应用系统,构建人工智能和生物技术融合的交叉研究平台,实现基因序列和注释信息、DNA甲基化、组蛋白修饰及DNA甲基化智能预测和一体化展示,为水稻生长发育、基因表达调控、环境信号响应等研究提供表观组学大数据、全基因组图谱和人工智能预测,创制具有预期性能的生物农业产品,大幅度提升生物产品的创制效率。

eRice数据库目前整合了粳稻品种“日本晴”、籼稻品种“93-11”等系列特征种质资源的DNA腺嘌呤甲基化和胞嘧啶甲基化全基因组图谱、腺嘌呤甲基化的人工智能预测数据、组蛋白修饰组学数据、基因组注释信息、基因序列信息以及预测得到的调控元件等数据。用户可根据想要查询的基因区域对相关表观遗传修饰进行检索,同时可对已知序列进行比对、查询和甲基化位点的预测,并利用可视化工具对多类型修饰位点进行直观比较。

eRice数据库链接:http://www.elabcaas.cn/rice/index.html

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