2022年由农业农村部批准建设。实验室聚焦农业微生物创新链条的重大科学与技术瓶颈问题，开展微生物前沿理论与关键技术研发，拟突破农业微生物重大产品创制新工艺与产业应用新技术，推动我国农业生物技术产业升级换代、培育未来食品等新兴产业发展，为促进我国农业绿色高质量发展提供核心战略资源和关键技术支撑。