2009年6月获得中国农业大学 微生物学专业 理学博士学位;
2009年7月-2013年6月在中国农业科学院生物技术研究所从事博士后研究;
2017年1月-2022年12月中国农业科学院生物技术研究所 副研究员;
2023年1月至今中国农业科学院生物技术研究所 研究员。
社会兼职:北京微生物学会理事;中国农业生物技术学会微生物生物技术分会理事。
人才团队
农业微生物学研究中心
微生物智能设计与合成创新团队
林敏课题组
生物化学与分子生物学
主要研究领域与成果:
主要从事固氮微生物分子遗传学、微生物非编码RNA与基因表达调控等相关领域的研究。
针对根际联合固氮菌基因表达受环境影响大、田间效率低下等天然缺陷,以根际联合固氮施氏假单胞菌为研究对象,解析固氮酶活性调控和根际适应机制并构建人工固氮体系,取得如下进展:
1、在鉴定首个直接参与固氮酶活性调控的非编码RNA基础上(PNAS, 2016),进一步鉴定了6个参与高效固氮调控的非编码RNA,并解析了其介导的分子机制,研究结果发表在Appl Environ Microbiol (2019),J Bacteriol (2019)和iScience (2022);
2、基于天然非编码RNA的结构骨架,建立了靶向调控、特异表达的人工非编码RNA设计原则,在转录后水平实现了对靶标基因表达的精准调控,为合成生物学智能模块构建提供了技术手段,申请发明专利6项;
3、采用人工非编码RNA调控技术定向改造胞内氮代谢流向,获得了新一代高效泌铵工程菌,泌铵能力提高2倍,相关工作获2021年度科技部“全国颠覆性技术创新大赛”优胜奖。
先后主持国家重点研发计划课题1项、国家自然科学基金课题2项、国家博士后基金1项、中央级公益性科研院所科研业务费4项。在PNAS, Journal of bacteriology, Res Microbiol, PLOS ONE, BMC Genomics等国际刊物上发表SCI论文30余篇,其中第一作者或通讯作者发表SCI论文14篇,申请国家发明专利20余项。
主持项目:
1、国家重点研发计划课题“高效利用碳源和能量的固氮菌底盘设计及优化适配”(2022YFA0912101),2022年11月至2027年10月;
2、国家自然科学基金“施氏假单胞菌非编码RNA介导的根际抗逆固氮机制”(32370091),2024年1月至2027年12月;
3、国家自然基金“固氮施氏假单胞菌非编码RNA crcZ和crcY在碳代谢抑制中的协同作用机制”(31400076),2015年1月至2017年12月;
4、中央级公益性研究院所科研业务费“固氮施氏假单胞菌非编码RNA的功能研究”,2016年9月至2017年12月;
5、中央级公益性研究院所科研业务费“固氮施氏假单胞菌RNA分子伴侣蛋白Hfq的功能鉴定”,2015年1月至2015年12月;
6、中央级公益性研究院所科研业务费“非编码RNA34在固氮施氏假单胞菌氮代谢调控中的功能研究”,2014年1月至2014年12月.
主要专利:
1、国家发明专利:一个特异响应渗透胁迫信号的启动子及应用,专利号:ZL 201510237092.X,授权时间:2018.06.19,第一发明人;
2、国家发明专利:具有固氮基因沉默功能的人工非编码RNA 及其应用,专利号:ZL 202110948100.7,授权时间:2023.12.01,第二发明人;
3、国家发明专利:一种增强微生物固氮能力的人工非编码RNA模块,专利号:ZL 202010545585.0,授权时间:2022.06.28,第二发明人;
4、国家发明专利:特异响应逆境信号的nfiS基因的用途及其使用方法,专利号:ZL 201410262604.3,授权时间:2017.05.24,第二发明人;
5、国家发明专利:泌铵与氮高亲模块偶联的人工联合固氮体系,专利号:ZL 202010435008.6,授权时间:2022.03.11,第四发明人;
6、国家发明专利:一种抗氧化及耐高盐胁迫的人工合成sRNA及其用途,专利号:ZL 201510007581.6,授权时间:2017.12.15,第三发明人.
主要论文:
1、Yuhua Zhan, Yongliang Yan, Zhiping Deng, Ming Chen, Wei Lu, Chao Lu, Liguo Shang, Zhimin Yang, Wei Zhang, Wei Wang, Yun Li, Qi Ke, Jiasi Lu, Yuquan Xu, Liwen Zhang, Zhihong Xie, Qi Cheng, Claudine Elmerich, Min Lin. The novel regulatory ncRNA, NfiS, optimizes nitrogen fixation via base pairing with the nitrogenase gene nifK mRNA in Pseudomonas stutzeri A1501. PNAS. (2016), E4348-4356 (第一作者);
2、Fanyang Lv#, Yuhua Zhan#, Wei Lu, Xiubin Ke, Yahui Shao, Yiyuan Ma, Juan Zheng, Zhimin Yang, Shanshan Jiang, Liguo Shang, Yao Ma, Lei Cheng, Claudine Elmerich, Yongliang Yan, Min Lin. Regulation of hierarchical carbon substrate utilization, nitrogen fixation, and root colonization by the Hfq/Crc/CrcZY genes in Pseudomonas stutzeri. iScience. (2022), 25(12),105663 (并列第一作者);
3、Hongyang Zhang#, Yuhua Zhan#, Yongliang Yan, Yichao Liu, Guihua Hu, Shanshan Wang, Hua Yang, Xuemeng Qiu, Yaqun Liu, Jiang Li, Wei Lu, Claudine Elmerich, Min Lin. The Pseudomonas stutzeri-specific regulatory ncRNA, NfiS, targets the katB mRNA encoding a catalase essential for optimal oxidative resistance and nitrogenase activity. Journal of Bacteriology. (2019), 201(19):1-16(并列第一作者);
4、Yuhua Zhan, Yongliang Yan, Wei Zhang, Haiying Yu, Ming Chen, Wei Lu, Shuzhen Ping, Zixin Peng, Menglong Yuan, Zhengfu Zhou, Claudine Elmerich and Min Lin. Genome sequence of Acinetobacter calcoaceticus PHEA-2, isolated from industry wastewater. Journal of Bacteriology. (2011), 193(13): 3422-3423 (第一作者);
5、Yuhua Zhan, Zhiping Deng, Yongliang Yan, Hongyang Zhang, Chao Lu, Zhimin Yang, Liguo Shang, Yi Huang, Fanyang Lv, Yaqun Liu, Yichao Liu, Shanshan Wang, Sanfeng Chen, Xue-Xian Zhang, Qi Cheng, Min Lin. NfiR, a new regulatory noncoding RNA (ncRNA), is required in concert with the NfiS ncRNA for optimal expression of nitrogenase genes in Pseudomonas stutzeri A1501. Applied and Environmental Microbiology. (2019), 85(14): e00762-19(第一作者);
6、Zhimin Yang, Qin Li, Yongliang Yan, Xiubin Ke, Yueyue Han, Shaoyu Wu, Fanyang Lv, Yahui Shao, Shanshan Jiang, Min Lin, Yunhua Zhang, Yuhua Zhan. Master regulator NtrC controls the utilization of alternative nitrogen sources in Pseudomonas stutzeri A1501. World Journal of Microbiology and Biotechnology. (2021), 37(10):177(通讯作者);
7、Yueyue Han, Chao Li, Yongliang Yan, Min Lin, Xiubin Ke, Yunhua Zhang, Yuhua Zhan. Post-transcriptional control of bacterial nitrogen metabolism by regulatory noncoding RNAs. World J Microbiol Biotechnol. (2022), 6;38(7):126(通讯作者).