生物所“未来农业”青年科技论坛聚焦找回“丢失的遗传力”

6月15日,由中国农业科学院科技管理局主办、生物技术研究所承办的“未来农业”青年科技论坛开讲,邀请中国农业科学院深圳农业基因组研究所周姚博士做了题为“利用图泛基因组找回丢失的遗传力”的报告,为解析生物复杂性状的遗传机制及作物育种提供了新思路。

遗传力是某一性状受遗传控制的程度,由于作用比较微弱而难以检测到的遗传力被称为“丢失的遗传力”,找回这些“丢失的遗传力”将有助于理解复杂性状的遗传机制。周姚介绍了番茄图泛基因组的构建及其在找回“丢失的遗传力”中的应用。利用图泛基因组对复杂的结构变异(structure variation, SV)进行全基因组检测,提高了检测能力和预测的准确率,解决了等位基因异质性和位点异质性导致的GWAS检测能力下降问题;结合番茄的转录组及代谢组数据,从不同的角度找回了“丢失的遗传力”,重新找回的遗传力将帮助育种家培育出具有更优良性状的番茄品种。

报告会通过线上的形式举行,来自我院及院外高校、科研院所的科研人员、研究生200余人参加。

周姚,2019年在中国科学院遗传与发育生物学研究所做博士后研究,出站后加入中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所,长期从事作物复杂性状的数量遗传学分析和基因组选择,参与开发了全基因组关联分析模型BLINK。在小麦中,通过对小麦属的群体遗传分析,鉴定了小麦属内四倍体和六倍体之间广泛的基因流,并发现小麦属以及禾本科作物间在驯化和人工选择中存在趋同演化特征。构建了首个番茄图泛基因组,并结合转录组数据开发了一套分析遗传异质性的统计分析流程。研究结果发现结构变异可解决“遗传力丢失”的问题并可促进作物遗传育种。研究成果以第一作者发表在Nature、Nature Genetics、Briefings in Bioinformatics等杂志。

“未来农业”青年科技论坛聚焦农业学科“横切面”的专业共性技术,以专题报告的形式探讨前沿技术的突破性进展,交流前沿技术支撑基础研究、核心关键技术研发等科学问题解析的思路,打造学科技术支撑与交叉辐射的媒介,助力全院九大学科集群研究效能的持续提升。基于本平台,现面向全国农业科技创新工作者征集报告需求选题,欢迎推介前沿或交叉学科青年专家作主题报告。征集邮箱:nkdb@caas.cn